一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統續作，一克帝國一統十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區的東伐西討、南征北戰，以及探秘發現未知區域及其他國度的奇幻旅程（根據小說一克帝國異域志內容改編而成）。

傳說中的“死者之書”消失千年后再度現世，各國高層蠢蠢欲動，暗中發起了爭奪之戰，而剛從監獄里完成任務出來的吉薩，本想拿著傭金先休息幾個月，卻因意外和考古界泰斗的孫女巫晴晴卷入了這場巨大的危機當中，可吉薩的體內，卻封印著其中一部分“死者之書”的力量！

為防止門人脫離學派宗旨，墨家設有不為人知的組織“本墨”，以秘術監視、協助墨者開展兼愛天下的理念。戰國末期，墨家三分，遙遠、云飛、司空曼作為秦、楚、齊三國的本墨，為了彼此共同的理想，展開了波瀾瀾壯闊的戰國旅程

在與現實世界極為相似的平行世界里，虛擬現實技術極度發達，一群在現實中身份各異的少年，進入了名為尋找公主的虛擬現實游戲中，并在游戲中成為了朋友。殊不知這是一款由掌權者打造的，一款專門用于選拔的游戲。孩子們在游戲種產生的數據會被電腦計算，篩選，最終選出智力，力量等各方面異于常人的潛力孩子，被選出的孩子將在特攻學院中進行特殊培訓，最終之戰將在現實展開。